Idealización de la filogenia de los grandes grupos
Cladística
La cladística trata de definir relaciones evolutivas o filogenéticas entre organismos basadas en similitudes derivadas.
La información utilizada es de una gran variedad, incluyendo además de la morfológica, secuencias de ADN (sistemática molecular).
Taxones
Monofiléticos: incluyen todos y cada uno de los descendientes de un antepasado común. Sólo los taxones pueden ser considerados en las clasificaciones filogenéticas.
Parafilético: si falta alguno de los descendientes y se trata de un taxón, no debe ser considerado en una clasificación auténticamente filogenética al impedirse reconstruir su historia evolutiva.
Polifiléticos: incluye líneas evolutivas separadas, pueden ser grupos homólogos pero filogenéticamente no comparten un único ancestro común.
Clados
Cada conjunto filético se denomina clado o linaje y los esquemas, gráficos arborescentes o dendrogramas representando las líneas evolutivas de denomina cladogramas.
En un cladograma los organismos o grupos de organismos están unidos por bifurcaciones (árbol binario, con 2 ramas), cada bifurcación se denomina grupo hermano.
Un clado es cada uno de los subárboles formados, y se entiende que todos los organismos de un clado comparten un ancestro común.
Caracteres
Para desarrollar cladogramas los caracteres de los taxones se separan en los siguientes tipos:
apomórficos o apomorfía: derivados de los primitivos.
autapomórfico o autapomorfía: un carácter derivado que lo posee un sólo taxón de un grupo.
Caracteres compartidos
simplesiomorfías: es un conjunto de caracteres primitivos y compartidos por varios taxones, tienen poco valor en las clasificaciones filogenéticas, puesto que no son específicos del grupo ni han evolucionado dentro de él.
sinapomorfías: es un conjunto de caracteres derivados compartidos por más de un taxón, son los que deben considerarse en las clasificaciones filogenéticas.
Los caracteres autapomórficos no tienen valor en los análisis cladísticos ya que no incluyen información para la evolución del grupo.
Los caracteres sinapomórficos deben ser homólogos o heredados de un antepasado común en todos los taxones del grupo.
Hay que descartar los caracteres análogos que se han originado por convergencia, reversión o paralelismo y que definen la homoplasia.
En los análisis cladísticos los caracteres deben estar separados en estados y ordenados en una secuencia polarizada desde primitivos a derivados.
El estado primitivo de un carácter debe ser fijado, además de en el grupo objeto de análisis (grupo interno), en el grupo más próximo de la misma categoría (grupo externo), y que debe ser el estado más frecuente en dicho grupo externo.
El criterio que se sigue en Cladística se basa en el principio de máxima parsimonia, que establece que la relación entre los grupos se realiza considerando el mínimo número de transformaciones necesarias para pasar de los caracteres primitivos (plesiomórficos) a los caracteres derivados (apomórficos).