Mycological Research (2007) 111:509-547. 67 Autores.
Botánica. Historia. Filogenia Molecular
Angiosperm Phylogeny Group III
| Angiospermas | Angiospermas basales | ||||
| Mesangiospermas | Magnólidas | ||||
| Monocotiledóneas | |||||
| Eudicotiledóneas | Eudicotiledónas basales | ||||
| Eudicotiledóneas centrales (Gunnéridas) | Rósidas | Fábidas | |||
| Málvidas | |||||
| Astéridas | Lámidas | ||||
| Campanúlidas | |||||
Sistema de clados APG II
| clado angiospermas | clado magnólidas | ||
| clado monocotiledóneas | clado commelínidas | ||
| clado eudicotiledóneas | clado gunnéridas | clado rósidas | clado fábidas |
| clado málvidas | |||
| clado astéridas | clado lámidas | ||
| clado campanúlidas |
| APG Angiosperm Phylogeny Group | 1998 | An ordinal classification for the families of flowering plants | Annals of the Missouri Botanical Garden 85:531–553 |
| APG II | 2003 | An Update of the Angiosperm Phylogeny Group Classification for the orders and families of flowering plants: APG II. | Botanical Journal of the Linnean Society 141:399-436 |
| APG III | 2009 | An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG III | Botanical Journal of the Linnean Society 161:105–21 |
| Microsporidia | ||
| Kickxellomycotina | ||
| Zoopagomycotina | ||
| Entomophthoromycotina | ||
| Blastocladiomycota | ||
| Mucoromycotina | ||
| Neocallimastigomycota | ||
| Chytridiomycota | ||
| Gomeromycota | ||
| Dikarya | Ascomycota | |
| Basidiomycota | ||
Hacia finales del siglo XX se acumuló una gran cantidad de información sobre secuencias de ADN de plantas, fundamentalmente del gen rbcL del cloroplasto.
Los análisis cladísticos permitieron utilizar una gran cantidad de información de bases de datos, elaborando árboles filogenéticos que agrupaban diferentes clados.
Los resultados obtenidos no sostenían los sistemas filogenéticos clásicos basados fundamentalmente en características morfológicas.
APG 1998: se propone una nueva clasificación, 462 familias ordenadas en 40 órdenes reunidos en grupos supuestamente monofiléticos: monocotas, commelinoides, eudicotas, eudicotas nucleares, rósidas y astéridas.
APG II 2003: las angiospermas se agrupan en 415 familias ordenadas en 59 órdenes que se agrupan en clados.
Se desarrolla la nomenclatura filogenética, implica que los taxones sean monofiléticos, no aparecen rangos o categorías y se propone abandonar el sistema de tipificación.